北京航空航天大学许燕老师2019年04月09日MICS在线学术讲座成功举办!
医学图像计算青年研讨会(Medical Imaging Computing Seminar,MICS)创立于2014年,其宗旨是为医学图像领域的华人青年学者提供学术交流平台,增进相互之间的了解和友谊,帮助青年学者融入学术研究大家庭。MICS聚焦于近两年内的医学图像计算领域原创研究,欢迎医学图像处理、计算机视觉、人工智能等新理论、新方法、新应用的展示,以及影像与临床医学、基础医学深度交叉的突破性进展报告。
首届MICS在医学图像领域著名学者、北卡罗来纳大学教堂山分校沈定刚教授的倡议下,于2014年12月在深圳大学举行。经过2015(济南)、2016(广州)、2017(上海)、2018(南京)的蓬勃发展,MICS从参会人数不足百人到吸引上千名专家学者参与,已迅速成为全国医学图像计算领域最具影响力的活动之一。
第六届医学图像计算青年研讨会将于2019年7月13-14日在苏州大学举办。在此,谨对本领域专家学者长期以来的大力支持表示感谢,并欢迎广大青年学者莅临苏州大学,积极参与MICS 2019,共同繁荣MICS大家庭!
在本次Webinar中,许燕老师基于其团队的研究成果,探讨了弱监督和无监督学习在医学图像中的应用,及其在提高现有医疗数据的临床应用价值。人工智能模型需要标注大量的数据,能够标注医学图像数据的专家又非常稀缺,标注成本很高。弱监督学习和无监督学习,能大大克服人工智能算法需要大量医生高成本标注的缺陷。弱监督学习由于不需要细粒度标注,极大降低了医学图像的标注成本,针对每个病人,医生标注时间从传统算法所需要的若干小时降低到秒这个数量级。无监督学习,可以不借助任何标注数据直接从样本中学习大量有效的规律,也成为近年医疗图像的热点问题。最后,许燕老师回答了观众所提出的相关问题。
问答环节
- 问:如果Area估计比真实的大很多,会有什么影响呢?答:我们实验中使用的L2 norm给出的惩罚项很大,会使得模型越来越准确,这样我们的模型就会很鲁棒。一旦有惩罚,Area估计就会缩小一些,这使得我们需要的segmentation准确率会提高。
- 问:老师请问细胞类型显著具体指什么呢?
答:例如在血癌细胞中,病理医生按照中性粒细胞,淋巴细胞,嗜酸性细胞等细胞在血液中的百分比,就能判断有无血癌。 - 问:先需要聚类算法对细胞水平进行分类吗?
答:不需要。在我们GAN的学习过程中,能够自动学习细胞特征,同时自动带了聚类的功能,所以不需要先进行聚类。 - 问:请问许老师,在用GAN进行数据生成的时候,真实的数据量有多大呢?如何保证Generator生成的数据可以逼近真实的细胞特征分布呢?
答:理论值在这里不能明确给出。但在我们血癌的实验中,我们使用了200多个病人的数据,大约有10万数量级的细胞数目来进行学习,图像级别的分类准确率达到95.7%,达到了临床可用的效果。此外,我们也验证了我们生成的数据与真实的细胞分布非常接近。 - 问:老师,您觉得anomaly detection 算无监督还是弱监督?
答:无监督就是不需要任何的标注信息,弱监督是只需要知道粗标签或者部分标签就能够predict细的或者精的标签,这就是弱监督的概念。 - 问:老师,无监督方法实验验证中,您使用的三个数据集有显著性差异吗?
答:有。我们实验的数据集实质上是两个数据集,A和B,第三个数据集实际是AB合在一起;其中一个数据集来自美国某大学,另一个是我们的合作单位浙江大学第一附属医院提供的数据集。所以在成片过程中有非常多的性质上的不同,因此它们的差异是非常明显的。 - 问:所以train的时候只有normal的样本,是算无监督还是弱监督?
答:如果train的过程只有normal的样本,只predict normal的信息出来,这属于全监督;但如果还进一步predict差异性的信息,比如有癌无癌,此时我们认为这属于弱监督。因此,这取决于你的任务,如果你只需要predict normal的结果,则是全监督。 - 问:请问一下许老师,您怎么看待医学图像中用ImageNet或者VGG16等网络模型进行pretrain的做法?有些文章这样做,是真的对医学图像有效吗?
答:有效。ImageNet产生的model,具有表达物体特征的能力,例如圆弧曲线和三角曲线等,对2D的医学图像大部分是有帮助的。即使没有帮助,也不会降低performance。 - 如果癌变区域比较小,半监督的这种方法,大部分取的patch都应该是正常组织吧?
答:对。在training过程中可以balance正例与负例的比例。
许燕教授报告的视频链接:
http://www.iqiyi.com/w_19s823nyfl.html#vfrm=8-8-0-1
特别鸣谢本次Webinar主要组织者:
MICS Webinar责任委员:何宏建(浙江大学)
活动须知
- MICS在线学术讲座依托在线直播平台进行,观众请点击每期直播链接参加活动,支持安装Windows系统的电脑、MAC电脑、手机等设备,手机客户端也可直接扫描二维码进入直播;
- 活动开始前5分钟左右,讲者会开启直播,活动时讲者会上传PPT或共享屏幕,观众可以看到Slides,听到讲者的语音,并通过聊天功能与讲者交互;
- 活动过程中,请不要说无关话语,以免影响活动正常进行;活动过程中,如出现听不到或看不到视频等问题,建议退出再重新进入,一般都能解决问题;建议通过速度较快的网络参加活动,优先采用有线网络连接;活动过程中,请不要说无关话语,以免影响活动正常进行;
- 后续每期讲座信息,会通过MICS微信公众号“医学图像计算青年研讨会”(扫描下方二维码关注MICS微信公众号)或MICS QQ群(群号:641894878)进行通知(注:申请加入MICS QQ群时需验证姓名、单位和身份,缺一不可;入群后,请实名,姓名身份单位;身份:学校及科研单位人员T,企业研发I,博士D,硕士M)。

“医学图像计算青年研讨会”微信公众号
MICS在线学术讲座的模式和组织方式借鉴了很多VALSE的经验, 从VALSE得到了很多的启发,在此对VALSE组委会表示衷心的感谢,也祝愿MICS和VALSE越办越好!
